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自2001年來，模式動物研究所成員共承擔研究國家和省部級項目60余項，其中包括有國家“十五”攻關重點項目、國家“十一五”科技支撐重點課題、國家基礎研究重點項目、十五國家重大科技專項、973項目、863項目、國家杰出青年基金，國家自然科學基金重大項目、國家自然科學基金面上項目等，項目經費合同差雀金額近1.5億元。自2005年至今，我所科學家共發(fā)表SCI源論文百余篇 。
國家遺傳工程小鼠資源庫建立了成熟完善的轉基因、基因剔除和ENU化學誘變等基因組改造技術，運用國際上先進的BAC重組技術，成為亞洲最大的基因剔除技術服務中心，已經成功制備了300余種轉基因小鼠和基因敲除小鼠品系。通過科研合作和培訓等方式，向國內22個省市自治區(qū)的數(shù)百家科研單位、醫(yī)院及制藥企業(yè)提供各種小鼠模型，協(xié)助國內（包括香港）的百余個優(yōu)秀實驗室開展轉基因與基因剔除小鼠的研究，合作單位幾乎囊括了國內所首基有的優(yōu)秀科研院校。資源庫擁有豐富的疾病模型資源，是國際上最大的小鼠品系資源中心之一（500余種），其中包括糖尿病、腫瘤、心血管疾病、肥胖癥、發(fā)育缺陷等300多種人類者慶謹疾病的動物模型，其中擁有自主產權的疾病模型已經超過100種。同時，建立了完善的質量管理體系，于2006年通過國際AAALAC論證 。
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這旦卜些動物都是來自大自模判穗然中或者通過人工繁衍，人工養(yǎng)殖的方式得來的，盈利模式是通過這些動物在動物園的表演以及門沖鍵票進行盈利。
研究所的主要學科發(fā)豎臘展方向物纖吵是遺傳學與功能基因組學。遺傳學和功能基因組學是現(xiàn)代生物學的核心學科，其發(fā)展對其它生物醫(yī)學領域的發(fā)展有關鍵性的輻射作用。它的發(fā)展目標是通過引進優(yōu)秀專業(yè)人才，形成具有國際水平的研究群體和學科梯隊，開展基礎性、創(chuàng)新性研究，加強與國際、國內優(yōu)秀研究群體的合作，大力發(fā)展遺傳學和功能基因組學的研究和學科罩侍建設，最終使之成為集科技資源服務、科學研究和人才培養(yǎng)為一體的國家級基地 。
研究院集研發(fā)、科技支撐和人才培訓于一體，依托南京大學在疾病模型研發(fā)領域國際領先的科技、人才和信息優(yōu)勢，瞄準未來國際生物醫(yī)藥的發(fā)展方向，在南京高新區(qū)打造國際知名的、引領全國乃至世界的“生物谷”。該研究院依托南京大學模式兄源悶動物研究所和藥物開發(fā)國際合作，力爭經過五年的建設，在現(xiàn)有教育部重點裂遲實驗室的基礎上，發(fā)展成為國家重點實驗室。同時，還將依托南京大學的教學資質和研究院的科技隊伍和科技資源，為國內外，特別是南京市和高新開發(fā)區(qū)培育生物醫(yī)藥行業(yè)高羨彎層次的創(chuàng)新人才、技術人才和管理人才，為產業(yè)聚集營造人才保障和人力資源庫。
