目錄世界兩大生物數(shù)據(jù)庫 生物信息數(shù)據(jù)庫分級 世界三大生物數(shù)據(jù)庫 生物信息三大數(shù)據(jù)庫 生物信息數(shù)據(jù)庫有哪些
按大小可以分為1.公共數(shù)據(jù)庫
2. 從公共數(shù)據(jù)庫中取數(shù)據(jù)做進一步處理的專業(yè)數(shù)據(jù)庫，提供更多的分析
按功能分可以有
基因庫GENEBANK，蛋白庫辯讓帶UNIPROT, 結(jié)構(gòu)庫攜蘆PDB, 功能分類 GO庫，通路庫 KEGG。
不用專注于4這個數(shù)字。隨著科研的進步還會有更多的數(shù)滑蠢據(jù)庫出來。
三大國際生物資派歲純源數(shù)據(jù)庫的重要性和意義
NCBI (National Center for Biotechnology Information，美國國立生物技術(shù)信息中心）于1988年11月4日建立，是NIH（美國國立衛(wèi)生研究院）的雀凱NLM（國立醫(yī)學(xué)圖書館）的一個分支。目的是通過提供在線生物學(xué)數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析來幫助人類更好的認知生物學(xué)問題。 目前有將近40個在線的文庫和分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫
為儲存和分析分子生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)知識創(chuàng)建自動化；
從事研究基于計算機的信息處理過程的高級方法，用于分析生物學(xué)上重要的分子和化合物的結(jié)構(gòu)與功能塵咐；
促進生物學(xué)研究人員和醫(yī)護人員應(yīng)用數(shù)據(jù)庫和；
努力協(xié)作以獲取世界范圍內(nèi)的生物技術(shù)信息。
一 美國國家生物技術(shù)信息中心NCBI(National Center for
Biotechnology Information)
NCBI是一個極具人性化的網(wǎng)站,網(wǎng)站的主頁清晰的闡明了NCBI所做的工作及相關(guān)領(lǐng)域最新的熱點內(nèi)容，新聞等。為了方便使用者更加熟練使用網(wǎng)站資源，陸顫NCBI在主頁清晰的標注了站點導(dǎo)航，非常便于初學(xué)者熟悉和掌握NCBI的站內(nèi)資源。
另外，NCBI將其網(wǎng)站資源列于主頁左側(cè)，其中包括：SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature
databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at
NCBI, Software engineering, Education, FTP site, Contact
information等等。
二EBI(European
BioinformaticsInstitute)歐洲生物信息研究所The European
Bioinformatics Institute（EBI）桐悉褲是目前國際上幾個重要分子生物信息網(wǎng)站之一，位置座落于英國The Wellcome Trust
Genome Campus。EBI的任務(wù)就是確保分子生物與基因體的研究信息可以公開并且免費提供給科學(xué)社群，以促進科學(xué)進步。
EBI所提供的服務(wù)包括建立/維護數(shù)據(jù)庫、提供分子生物相關(guān)信息服務(wù)、執(zhí)局簡行分子生物與計算分子生物研究；所服務(wù)的對象與研究人員擴及各產(chǎn)業(yè)，包括分子生物、基因體、醫(yī)學(xué)與農(nóng)業(yè)學(xué)術(shù)研究、農(nóng)業(yè)、生物技術(shù)、化學(xué)與制藥工業(yè)。
三DDBJ(DNAData Bank of
Japan)日本核酸數(shù)據(jù)庫
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)
設(shè)立在日本國家遺傳研究所（NIG），于1986年開始DNA數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建工作。從一開始，DDBJ就作為國際性DNA數(shù)據(jù)庫之一，發(fā)揮著重要的作用。它
首先反映的是日本國內(nèi)數(shù)據(jù)庫的資源，并與NCBI,EBI進行頻繁的國際性合作。DNA序列中蘊含了大量的數(shù)據(jù)資源，比起其它生物學(xué)數(shù)據(jù)，它在闡述進化方面的作用更為直接。因此，探求DNA數(shù)據(jù)庫，不僅是在生命科學(xué)方面的研究，更是為人類的發(fā)展謀福利。
DDBJ是日本唯一的DNA數(shù)據(jù)庫，它從研究者那里收集DNA 序列并且給數(shù)據(jù)提交者一個國際公認的編碼。DDBJ
主要從日本研究者那里收集數(shù)據(jù)，當(dāng)然，它也接受外國研究者的數(shù)據(jù)并給以編碼。
國際著名的三大蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫有UniProt數(shù)據(jù)庫、The Human Protein Atlas數(shù)據(jù)庫、PhosphoSitePlus數(shù)據(jù)庫升者陪。
1、UniProt數(shù)據(jù)庫
蛋白組學(xué)常用數(shù)據(jù)庫UniProt（全稱UniProt Protein Resource），建立于1986年，由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫聯(lián)合成立的，其信息量豐富、資嫌鍵源廣泛，是目前公認的首選免費蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫。
2、The Human Protein Atlas數(shù)據(jù)庫
The Human Protein Atlas內(nèi)含近30000種人類蛋白質(zhì)的組織和細胞分布信息，并提供免費查詢。
瑞典Knut&Alice Wallenberg基金會利用免疫組化技術(shù)，檢查每一種蛋白質(zhì)在人類48種正常組織，20種腫瘤組織，47個細胞系和12種血液細胞內(nèi)的分布和表達，其結(jié)果用至少576張免疫組化染色圖表示，并經(jīng)專業(yè)人員校對和標引，保證染色結(jié)果具有充分的代表性。
3、PhosphoSitePlus數(shù)據(jù)庫
PhosphoSitePlus數(shù)據(jù)庫是一個由CST和NIH聯(lián)合開發(fā)的免費資源數(shù)據(jù)庫，總結(jié)歸納了海量通過科學(xué)研究發(fā)現(xiàn)的蛋白修飾位點，包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等，并且包括一些CST公司發(fā)現(xiàn)但未發(fā)表的蛋白修飾位點。
該數(shù)據(jù)庫是動態(tài)的、開放的、高度互動并持續(xù)更新的。它有助于研究PTMs在正常和病理細胞/組織中的作用，同時它也是發(fā)現(xiàn)新的疾病標志物和藥物靶點的有力。
性能及歷史
蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫（HPDB），建于2005年5月，動態(tài)展示生物大分子立體結(jié)構(gòu)，鼠標點擊放大分子結(jié)構(gòu)、原子定位、測定原子之間距離，可用于教學(xué)或科研。服務(wù)對象吵蠢是能夠熟練使用中文的生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、農(nóng)學(xué)、林學(xué)等領(lǐng)域的大中專學(xué)生、教師及科技工作者。
分子結(jié)構(gòu)特征描述采用漢語，同時提供英文原文以供考證。對于善于使用英文的讀者，我們提倡直接訪問RCSB PDB，一來可以減少網(wǎng)絡(luò)擁擠，二來可以減少由于HPDB的翻譯不妥帶來的不便。
蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫（HPDB）對每個蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)說明部分做了中文翻譯（最新加入數(shù)據(jù)庫的分子除外），內(nèi)容包括分子結(jié)構(gòu)定性描述、樣品的來源、表達載體、宿主、化學(xué)分析方法、分子結(jié)構(gòu)組成成分等。這些信息并同蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)存儲于數(shù)據(jù)庫，因此HPDB支持中文查詢。
蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫（HPDB）雖然翻譯了“分子結(jié)構(gòu)說明”部分，但為了保證數(shù)據(jù)的可靠性和準確性，HPDB對一級結(jié)構(gòu)序列及大分子結(jié)構(gòu)坐標數(shù)據(jù)等未做任何改動，數(shù)據(jù)庫保持RCSB PDB核實后的原始實驗數(shù)據(jù)文件，并保持PDB文件格式和蛋白質(zhì)分子編號。
NCBI是團喊者美國國家生物技術(shù)信息中心。
美國國家生物技術(shù)信息中心（英文全稱：National Center of Biotechnology Information），簡稱：NCBI，塌薯位于馬里蘭州的貝塞斯達，建立于1988年， 是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館（NLM）滲大的一部分。
NCBI有一個多學(xué)科的研究小組，包括計算機科學(xué)家、分子生物學(xué)家、數(shù)學(xué)家、生物化學(xué)家、實驗物理學(xué)家和結(jié)構(gòu)生物學(xué)家，集中于計算分子生物學(xué)的基本的和應(yīng)用的研究。
